More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0897 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0897  Integrase catalytic region  100 
 
 		 442 aa  910    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.157158  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4903  Integrase catalytic region  97.42 
 
 		 277 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4711  Integrase catalytic region  97 
 
 		 277 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5439  integrase catalytic subunit  71.24 
 
 		 278 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0603  integrase catalytic subunit  69.47 
 
 		 271 aa  333  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  56.39 
 
 		 263 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  55.86 
 
 		 267 aa  237  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  55.86 
 
 		 267 aa  237  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  55.86 
 
 		 267 aa  237  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  42.8 
 
 		 273 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  42.55 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  42.24 
 
 		 282 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  40.34 
 
 		 307 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  40.44 
 
 		 284 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  38.72 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  39.21 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  39.48 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  39.21 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  39.04 
 
 		 260 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  39.66 
 
 		 286 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  41.23 
 
 		 274 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  41.7 
 
 		 289 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  41.03 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  41.03 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  41.03 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  41.03 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  38.33 
 
 		 290 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  38.33 
 
 		 290 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  38.53 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  43.53 
 
 		 297 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  36.36 
 
 		 237 aa  147  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  36.36 
 
 		 237 aa  147  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  36.36 
 
 		 237 aa  147  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  36.36 
 
 		 237 aa  147  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  35.51 
 
 		 278 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  35.93 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  38.33 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  35.51 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  35.93 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  35.93 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  35.93 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  35.93 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  36.56 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  37.28 
 
 		 274 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 250 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 		 284 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  39.65 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  37.93 
 
 		 269 aa  143  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0640  A, transposase OrfB  35.59 
 
 		 274 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  35.79 
 
 		 278 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  38.3 
 
 		 276 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  37.34 
 
 		 274 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  37.77 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  37.77 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  37.77 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  35.68 
 
 		 279 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  36.8 
 
 		 271 aa  140  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  35.55 
 
 		 282 aa  140  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  37.82 
 
 		 277 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  38.33 
 
 		 312 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2268  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2283  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1313  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336446  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2120  A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0978  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.43017  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  36.8 
 
 		 267 aa  140  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  36.8 
 
 		 267 aa  140  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2145  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0156  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>