82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3083 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 294 aa  591  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  90.14 
 
 		 294 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.78 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.96 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.48 
 
 		 392 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  46.61 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.5 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.19 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.63 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0823  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.09 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11398  Phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  25.72 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.924537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.57 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5449  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.6 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961923  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  40 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2419  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.87 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.623876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.05 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.58 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.26 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.91 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  35.45 
 
 		 185 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  34.86 
 
 		 185 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  47.06 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.56 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.86 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  33.33 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  34.13 
 
 		 174 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.08 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 		 174 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.84 
 
 		 178 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.9 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.89 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.78 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.79 
 
 		 194 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.63 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.96 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.86 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.64 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.91 
 
 		 179 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.08 
 
 		 176 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  34.44 
 
 		 175 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5863  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  45.31 
 
 		 168 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.27 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  34.45 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.16 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.2 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0544  hypothetical protein  30.73 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.62 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.86 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.58 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.11 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  25.52 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34 
 
 		 187 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  25.52 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.08 
 
 		 201 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  36.26 
 
 		 268 aa  45.8  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.08 
 
 		 169 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2901  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.8 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0866647  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  34.44 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.29 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.63 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  33 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.13 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.96 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  44.07 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.96 
 
 		 499 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  40.3 
 
 		 108 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1598  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.01 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.970961  hitchhiker  0.00000195096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.61 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.12 
 
 		 198 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.43 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1338  PAP2 family protein  34.48 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.52 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.4 
 
 		 191 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.78 
 
 		 182 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.14 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0869  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.31 
 
 		 187 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  35.23 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.17 
 
 		 460 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.14 
 
 		 169 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03667  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.58 
 
 		 230 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>