44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2880 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  477  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  53.68 
 
 		 530 aa  271  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  44.59 
 
 		 449 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  38.74 
 
 		 455 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  37.39 
 
 		 453 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  37.22 
 
 		 460 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  37.96 
 
 		 427 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  34.31 
 
 		 509 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 502 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  33.03 
 
 		 514 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  32.57 
 
 		 487 aa  121  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  32.27 
 
 		 480 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  32.27 
 
 		 473 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  33.03 
 
 		 514 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  32.11 
 
 		 492 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  33.18 
 
 		 553 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  33.18 
 
 		 529 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  33.03 
 
 		 488 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  31.65 
 
 		 510 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  29.73 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  33.18 
 
 		 561 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  35.78 
 
 		 481 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  31.86 
 
 		 491 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  31.19 
 
 		 512 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  31.19 
 
 		 512 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  30.88 
 
 		 491 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  30.39 
 
 		 488 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  30.39 
 
 		 488 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  30.39 
 
 		 488 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  30.45 
 
 		 477 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  31 
 
 		 564 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  28.77 
 
 		 469 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  24.24 
 
 		 463 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  24.24 
 
 		 463 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  24.68 
 
 		 463 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  22.71 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  24.55 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  29.13 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1806  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  23.33 
 
 		 580 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3456  hypothetical protein  71.88 
 
 		 52 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  25.91 
 
 		 498 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2438  hypothetical protein  24.65 
 
 		 534 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  24.42 
 
 		 572 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>