38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1156 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1289 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  37.74 
 
 		 1848 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  34.42 
 
 		 1453 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  32.57 
 
 		 1454 aa  61.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  43.24 
 
 		 688 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  37.98 
 
 		 869 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  32.45 
 
 		 1143 aa  54.7  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  35.46 
 
 		 979 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  37.61 
 
 		 902 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  31.69 
 
 		 1143 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  37.31 
 
 		 1127 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  33.33 
 
 		 672 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  39.34 
 
 		 901 aa  51.2  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  36.03 
 
 		 2081 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 1916 aa  50.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  32.56 
 
 		 1276 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  31.29 
 
 		 957 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  31.33 
 
 		 958 aa  48.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  33.33 
 
 		 955 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  37.78 
 
 		 1457 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  33.65 
 
 		 1672 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  31.62 
 
 		 1691 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  34.48 
 
 		 1196 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  31.78 
 
 		 958 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  30.88 
 
 		 457 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  32.33 
 
 		 1379 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  30.77 
 
 		 1525 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  32.73 
 
 		 2912 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  29.2 
 
 		 455 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  29.46 
 
 		 1053 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  33.08 
 
 		 939 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  29.2 
 
 		 455 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  35.4 
 
 		 2222 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  37.62 
 
 		 2803 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  32.8 
 
 		 1329 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  38.24 
 
 		 2026 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  28.57 
 
 		 1521 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>