72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1527 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
177 aa  364  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.16 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  38.53 
 
 
240 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.71 
 
 
240 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.71 
 
 
240 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  34.75 
 
 
146 aa  58.2  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.58 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02289  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.14 
 
 
223 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.14 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.33 
 
 
316 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  38.55 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4655  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.43 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84876  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3578  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.43 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4667  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.19 
 
 
220 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0815  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.29 
 
 
222 aa  52  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0339092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  35.48 
 
 
148 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4762  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.19 
 
 
220 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4817  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.19 
 
 
220 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.19 
 
 
220 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4677  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.19 
 
 
220 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3632  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.25 
 
 
221 aa  51.2  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.25 
 
 
221 aa  51.2  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3955  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.25 
 
 
221 aa  50.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  34 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5056  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.17 
 
 
225 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  33.33 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4649  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  31.93 
 
 
236 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  0.343196 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0782  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34.04 
 
 
221 aa  47.8  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0196066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4688  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.17 
 
 
220 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.041656  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.28 
 
 
182 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  31.52 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5726  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.11 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0664368  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.19 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3427  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.92 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0534408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  29.67 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.46 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3584  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.11 
 
 
221 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000456078  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04044  hypothetical protein  35.11 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4750  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.11 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.020864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3784  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  35.11 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015085  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.11 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000715657  normal  0.850161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04081  predicted regulator of cell morphogenesis and cell wall metabolism  35.11 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00617951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.11 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00129664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4463  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  35.11 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00510158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.28 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  31.19 
 
 
201 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0379  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  33.7 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000130602  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.75 
 
 
184 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  30.71 
 
 
411 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4224  hypothetical protein  31.08 
 
 
226 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  31.15 
 
 
410 aa  44.3  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  26.98 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  28.67 
 
 
764 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  27.61 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3627  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.45 
 
 
248 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.25 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0397  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.45 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000185602  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 
406 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.98 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.04 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.35 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0398  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.64 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0161377  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0383  hypothetical protein  30.47 
 
 
240 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  31.68 
 
 
491 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.65 
 
 
398 aa  42.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1338  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.67 
 
 
241 aa  42.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.164705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  25.9 
 
 
775 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.47 
 
 
182 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3025  hypothetical protein  35.79 
 
 
223 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  27.16 
 
 
270 aa  40.8  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.37 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0492  hypothetical protein  30 
 
 
238 aa  40.8  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>