More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3253 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3253  response regulator  100 
 
 		 123 aa  245  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3179  response regulator receiver domain-containing protein  90.68 
 
 		 120 aa  193  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.164981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3403  response regulator receiver protein  74.38 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.809384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3466  response regulator receiver protein  73.55 
 
 		 125 aa  191  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  71.19 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  73.73 
 
 		 126 aa  187  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  74.58 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2959  two component signal transduction response regulator  60.17 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.888929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0458  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1110  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 117 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3609  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 116 aa  94.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 116 aa  94.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2332  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2829  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2558  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  37.82 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  37.82 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3323  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.62 
 
 		 458 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.45 
 
 		 494 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0626  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 455 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.29 
 
 		 515 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2506  sensory box protein/sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.51 
 
 		 564 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 244 aa  70.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2280  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.87 
 
 		 453 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 240 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 237 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 237 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  31.2 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 448 aa  69.3  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1737  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151372  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.29 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0574  response regulator receiver  32.54 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  36.21 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.39 
 
 		 446 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  38.21 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  39.25 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 480 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  39.25 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1386  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  39.25 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.59 
 
 		 461 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  33.87 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.68 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2365  two component signal transduction response regulator  41.98 
 
 		 575 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  34.74 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  33.33 
 
 		 334 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1619  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  36.8 
 
 		 483 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0516  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 468 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000971097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  35.79 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3222  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.19 
 
 		 447 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0905113 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  33.33 
 
 		 334 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 239 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 223 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  31.71 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 180 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3091  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.04 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1812  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  36 
 
 		 483 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558233  hitchhiker  0.00750422 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4852  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2245  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1426  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.19 
 
 		 444 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3201  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1837  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  35 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>