More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1013 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  100 
 
 		 289 aa  577  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  74.05 
 
 		 292 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  71.08 
 
 		 287 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  52.61 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  40.41 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  39.43 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  45.77 
 
 		 179 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  38.29 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  43.21 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  38.89 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  29.44 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  33.03 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  37.85 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  37.85 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  31.87 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  37.34 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  41.14 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  44.63 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  30.52 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  44.63 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  43.8 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  43.8 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  41.33 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  49.58 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  43.8 
 
 		 156 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  44.63 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  34.47 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  31 
 
 		 343 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  42.98 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  45.11 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  44.36 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.37 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  31.03 
 
 		 525 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  45.9 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  29.56 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  44.63 
 
 		 525 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  43.8 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  39.16 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  43.51 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  41.54 
 
 		 242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  39.44 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  36.36 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  33.21 
 
 		 343 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  44.17 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  42.52 
 
 		 323 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  33.48 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  38.03 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  33.21 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  38.96 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  31.85 
 
 		 648 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  31.18 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  42.34 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  34.57 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  27.38 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  42.54 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  38.03 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  40 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  42.28 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  36 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  35.57 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  37.32 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  40.6 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  30.96 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  43.33 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  26.85 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  38.51 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  26.97 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  31.54 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  34.84 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  29.96 
 
 		 375 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  37.88 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  38.03 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  27.94 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  42.62 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4077  OmpA/MotB domain protein  27.49 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  33.85 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  40.94 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 305 aa  99.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  34.34 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  30 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  39.2 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  42.15 
 
 		 784 aa  99.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  29.07 
 
 		 362 aa  99.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  36.24 
 
 		 225 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  35.92 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  27.38 
 
 		 343 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  28.72 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  32.68 
 
 		 330 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  34.57 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  36.84 
 
 		 215 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  28.91 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>