68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0109 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 		 164 aa  316  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  86.59 
 
 		 206 aa  258  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  62.2 
 
 		 205 aa  190  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  60.49 
 
 		 200 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  61.35 
 
 		 199 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  60.74 
 
 		 199 aa  157  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.37 
 
 		 202 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.37 
 
 		 202 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  38.71 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  38.71 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.87 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.89 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  36.13 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.16 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.53 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  29.3 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.85 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.05 
 
 		 264 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.68 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  33.06 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.29 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.12 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  26.49 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.39 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  32.91 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  29.22 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  29.7 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.66 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  26.43 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  27.71 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  27.22 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  28.3 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  34.43 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  29.37 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  32.86 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  31.1 
 
 		 193 aa  44.3  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  28.08 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.92 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.83 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.19 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 		 175 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  25.97 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  25.97 
 
 		 179 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  36.94 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  29 
 
 		 264 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  31.46 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.33 
 
 		 732 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 		 178 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>