63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4070 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
265 aa  547  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  48.06 
 
 
272 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  47.71 
 
 
268 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  47.71 
 
 
268 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4454  purine phosphorylase family 1  48.19 
 
 
274 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0965  purine phosphorylase family 1  46.47 
 
 
292 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470514  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  45.64 
 
 
273 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  30.62 
 
 
252 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  43.31 
 
 
269 aa  106  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0955  phosphorylase, Pnp/Udp family  27.38 
 
 
254 aa  92  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0510178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  29.76 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  28.64 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  32.62 
 
 
256 aa  88.6  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  33.06 
 
 
253 aa  79  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  36.97 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  28.95 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  27.57 
 
 
241 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  23.4 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  28.57 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  27.03 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  29.37 
 
 
241 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  27.27 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1606  purine or other phosphorylase family 1  21.36 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  28.29 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  25.88 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  27.59 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  28.67 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  28.28 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  28.28 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  34.4 
 
 
253 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  25 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  25.3 
 
 
271 aa  49.7  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  23.23 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0910  purine or other phosphorylase family 1  28.67 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303015  normal  0.357288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  25 
 
 
242 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  22.88 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  30.52 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0414  hypothetical protein  29.17 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  23.04 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  21.54 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1675  purine or other phosphorylase family 1  20.83 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  24.19 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  25.15 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  23.58 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  26.47 
 
 
275 aa  45.4  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  27.87 
 
 
240 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  31.03 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  30.4 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  22.75 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  27.08 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  22.62 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  22.64 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0368  AMP nucleosidase  27.21 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  24.18 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  22.62 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  22.75 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  22.75 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  22.16 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  22.75 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  24.03 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  22.16 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  24.84 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  24.03 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>