38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2776 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  74.88 
 
 		 245 aa  345  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  59.17 
 
 		 221 aa  276  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  59.26 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  54.88 
 
 		 237 aa  236  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  51.14 
 
 		 250 aa  204  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  47.47 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0347  hypothetical protein  46.45 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.743739  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1218  hypothetical protein  47.64 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.210535  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  48.89 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  46.08 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  44.92 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1959  RES  46.11 
 
 		 258 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  41.75 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  38.94 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3334  hypothetical protein  45.1 
 
 		 250 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  39.11 
 
 		 248 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2090  RES domain protein  36.62 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  42.78 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  41.75 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  41.18 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  38.46 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  31.93 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  36.52 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  32.5 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  27.83 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  27.83 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  34.03 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  32.2 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  35.65 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  35.51 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  34.78 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  30.08 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  36.46 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  34.85 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  33.91 
 
 		 233 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  33.91 
 
 		 233 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  33.91 
 
 		 233 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>