250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2681 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  70 
 
 
264 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  59.24 
 
 
260 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  50.59 
 
 
262 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.23 
 
 
262 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.27 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  37.55 
 
 
269 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  37.65 
 
 
284 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  31.75 
 
 
238 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.97 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.4 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  31.07 
 
 
249 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  31.78 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  30.7 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  30.32 
 
 
281 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  29.44 
 
 
237 aa  88.6  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  30.3 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  32.5 
 
 
241 aa  86.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  28.72 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  24.58 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  28.23 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  28.04 
 
 
246 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  24.02 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.69 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.61 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  28.11 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  29.39 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.21 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.21 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.21 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.21 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.21 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.21 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.21 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  27.18 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  26.7 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  26.7 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  26.7 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  31.77 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  26.7 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.03 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  26.67 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  26.21 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  26.67 
 
 
241 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  30.89 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  26.21 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.61 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  33.83 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  25.73 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.1 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  30.05 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.62 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  24.51 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  27.23 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  26.21 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.6 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  26.61 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  26.79 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.95 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.57 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0870  protein-disulfide isomerase  36.62 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.92 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.67 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.36 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  26.16 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.86 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0642  thiol:disulfide interchange protein  27.24 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.374404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.12 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  24.27 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.79 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.64 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  26.06 
 
 
277 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2967  protein-disulfide isomerase  33.1 
 
 
159 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  26.79 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  25.13 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.63 
 
 
245 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
240 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  25.45 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  25.93 
 
 
282 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2160  hypothetical protein  26.97 
 
 
304 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.1 
 
 
253 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  26 
 
 
262 aa  62.4  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.79 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 
241 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  28.29 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
242 aa  62  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.62 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  25.62 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.96 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  21.84 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.14 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0933  hypothetical protein  24.58 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.430203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  23.27 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1066  thiol:disulfide interchange protein  24.62 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006488  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.73 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.73 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>