86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0870 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0870  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 164 aa  343  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2967  protein-disulfide isomerase  60.71 
 
 		 159 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3385  protein-disulfide isomerase  54.43 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0861  protein-disulfide isomerase  55.15 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  43.33 
 
 		 242 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  44 
 
 		 242 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  48.18 
 
 		 235 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  46.72 
 
 		 267 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  43.36 
 
 		 250 aa  121  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  45 
 
 		 250 aa  121  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  44.12 
 
 		 268 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  40.3 
 
 		 253 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2587  hypothetical protein  37.34 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0358064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  36.76 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  35.77 
 
 		 264 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  36.62 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  29.41 
 
 		 256 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  34.85 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  29.55 
 
 		 249 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  26.71 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  31.51 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  33.08 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  28.86 
 
 		 276 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.86 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0933  hypothetical protein  26.76 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.430203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  26.98 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  27.13 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  26.77 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.03 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  26.98 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  26.98 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  26.98 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.85 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.47 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  30.43 
 
 		 269 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  26.19 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.47 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.47 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.47 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.47 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.47 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.47 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  31.51 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  26.92 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  26.77 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.42 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  26.15 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  26.28 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.07 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  25.6 
 
 		 249 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  24.8 
 
 		 246 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 288 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  28.37 
 
 		 237 aa  52.4  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  31.34 
 
 		 252 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 		 339 aa  51.2  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  28.24 
 
 		 272 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  28.17 
 
 		 248 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  28.17 
 
 		 248 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  29.01 
 
 		 272 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  24.22 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.22 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.32 
 
 		 240 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  28.83 
 
 		 235 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  26.24 
 
 		 242 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  26.45 
 
 		 246 aa  48.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.21 
 
 		 246 aa  47.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  29.01 
 
 		 245 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 267 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  28.99 
 
 		 239 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 		 354 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  28.15 
 
 		 233 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  28.38 
 
 		 876 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.89 
 
 		 265 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.38 
 
 		 294 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.23 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  24.65 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  28.95 
 
 		 254 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 251 aa  42  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  24.65 
 
 		 245 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 268 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 		 238 aa  40.8  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  24.24 
 
 		 307 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  27.61 
 
 		 600 aa  40.8  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0642  thiol:disulfide interchange protein  27.34 
 
 		 275 aa  40.4  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.374404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>