82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1178 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
294 aa  591  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  90.14 
 
 
294 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.64 
 
 
268 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.15 
 
 
281 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.14 
 
 
392 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  44.61 
 
 
272 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.04 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.82 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.84 
 
 
305 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.72 
 
 
317 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0823  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.09 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  39.8 
 
 
175 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.19 
 
 
218 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.35 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  34.86 
 
 
185 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  35.78 
 
 
185 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.8 
 
 
174 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  38.78 
 
 
174 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.6 
 
 
205 aa  55.8  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11398  Phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  27.78 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.924537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.97 
 
 
185 aa  55.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.92 
 
 
204 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2419  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.42 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.623876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5449  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.63 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961923  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.16 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  45.59 
 
 
445 aa  54.3  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  31.97 
 
 
175 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.82 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.91 
 
 
179 aa  52.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.85 
 
 
182 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.05 
 
 
174 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5863  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.27 
 
 
168 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.03 
 
 
208 aa  49.7  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.7 
 
 
222 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.36 
 
 
171 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.84 
 
 
177 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.89 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0544  hypothetical protein  29.95 
 
 
290 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361856  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  37.36 
 
 
175 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.17 
 
 
181 aa  47  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.34 
 
 
169 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.18 
 
 
242 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.83 
 
 
194 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.16 
 
 
202 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  41.79 
 
 
108 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 
207 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.11 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.63 
 
 
280 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  33.61 
 
 
182 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.13 
 
 
212 aa  45.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.96 
 
 
499 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.5 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.343717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2901  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.14 
 
 
224 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0866647  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.65 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  24.48 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.85 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  37.21 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.37 
 
 
166 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.6 
 
 
191 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.59 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  24.48 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.08 
 
 
169 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  35.56 
 
 
178 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.4 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0869  hypothetical protein  32 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  36.26 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.43 
 
 
217 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1338  PAP2 family protein  34.48 
 
 
347 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  28.33 
 
 
170 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.93 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
460 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0748  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.73 
 
 
175 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0445246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.68 
 
 
189 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0774  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.73 
 
 
175 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3190  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.73 
 
 
175 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.276417  hitchhiker  0.000061179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.68 
 
 
189 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.71 
 
 
232 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.68 
 
 
227 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.69 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.75 
 
 
257 aa  42.4  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.19 
 
 
205 aa  42.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>