190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3143 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  100 
 
 
418 aa  847    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  99.75 
 
 
394 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  46.37 
 
 
399 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  46.37 
 
 
399 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  46.88 
 
 
445 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  42.34 
 
 
390 aa  280  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5412  transposase  78.57 
 
 
170 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0306805  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  45.92 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4487  transposase IS4 family protein  39.31 
 
 
403 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  42.08 
 
 
462 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  42.08 
 
 
462 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  42.08 
 
 
462 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  42.08 
 
 
462 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1302  IS4 family transposase  41.07 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24004  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  41.29 
 
 
427 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0265932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  42.09 
 
 
416 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  42.09 
 
 
416 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  42.09 
 
 
416 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  42.09 
 
 
416 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  42.09 
 
 
416 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  38.32 
 
 
402 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  40.36 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2904  transposase  45.26 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  39.54 
 
 
401 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  34.83 
 
 
444 aa  169  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6714  transposase  53.94 
 
 
225 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  32.76 
 
 
445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  31.35 
 
 
418 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  31.35 
 
 
418 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3015  transposase  41.96 
 
 
317 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837317  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5026  transposase-like protein  30.19 
 
 
433 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0403517  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  30.36 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2296  transposase  28.28 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00584103  normal  0.663647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2511  transposase  28.28 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160995  normal  0.39101 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  29.57 
 
 
431 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  29.19 
 
 
458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  31.59 
 
 
453 aa  136  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  31.59 
 
 
453 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  29.38 
 
 
451 aa  136  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3616  transposase  29.18 
 
 
467 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  32.25 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  32.25 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  32.25 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  32.25 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  32.25 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  32.25 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  32.25 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  29.38 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  29.38 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  32.55 
 
 
418 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  29.87 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  29.87 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  29.87 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  29.87 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  29.87 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  29.87 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3970  transposase IS4 family protein  31.68 
 
 
534 aa  133  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1937  hypothetical protein  45.89 
 
 
165 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  29.58 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  32.06 
 
 
463 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  29.46 
 
 
427 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  28.02 
 
 
469 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  31.59 
 
 
460 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  30.79 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  32.69 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  33.23 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  33.23 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04596  ISXo8 transposase  32.69 
 
 
375 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  33.12 
 
 
483 aa  120  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  32.58 
 
 
483 aa  120  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
460 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
453 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  32.59 
 
 
460 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  32.59 
 
 
460 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
460 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  33.01 
 
 
550 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  32.59 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  30.63 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  32.36 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  32.36 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  32.36 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  32.27 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  32.36 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  32.36 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  32.36 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  32.59 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  32.36 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  32.36 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
747 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  32.59 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  32.9 
 
 
747 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  32.59 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  32.59 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>