56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2310 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  92.44 
 
 
225 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  47.55 
 
 
273 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  47.55 
 
 
273 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  47.98 
 
 
301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  47.06 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  47.47 
 
 
304 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  50.55 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  43.06 
 
 
222 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  45.96 
 
 
219 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  42.06 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  41.09 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  46.7 
 
 
220 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  45.41 
 
 
256 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  41.28 
 
 
239 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  39.63 
 
 
243 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  43.07 
 
 
449 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  36.62 
 
 
232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  39 
 
 
223 aa  151  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  37.3 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  36.36 
 
 
327 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  35.92 
 
 
347 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  41.71 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  36.92 
 
 
532 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  35.86 
 
 
251 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  35.98 
 
 
453 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  39.36 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  38.71 
 
 
218 aa  112  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  36.63 
 
 
230 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  36.14 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  36.06 
 
 
216 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  33 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  33.7 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  33.8 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  34.92 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  32.09 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  30.04 
 
 
257 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  30.14 
 
 
247 aa  62  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  32.49 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  31.34 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  27.59 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  27.39 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  28.8 
 
 
232 aa  52  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  26.5 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  27.78 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  37.84 
 
 
82 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  27.27 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  27.27 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 
426 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  31.08 
 
 
428 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
495 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  24.6 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  26.42 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  22.56 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  24.51 
 
 
225 aa  41.6  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>