More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1707 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  100 
 
 		 451 aa  883    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  79.6 
 
 		 458 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  69.76 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  71.05 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  69.45 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  69.09 
 
 		 430 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  71.91 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  68.79 
 
 		 432 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  68.44 
 
 		 429 aa  594  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  70.05 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  75.26 
 
 		 432 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  66.59 
 
 		 448 aa  579  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  70.11 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  67.93 
 
 		 430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  67.41 
 
 		 437 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  72.57 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  70.87 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  66.89 
 
 		 432 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  65.92 
 
 		 462 aa  554  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  65.48 
 
 		 449 aa  551  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  66.44 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  64.49 
 
 		 459 aa  545  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  71.5 
 
 		 435 aa  527  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  61.76 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  61.07 
 
 		 433 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  58.46 
 
 		 431 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  61.47 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  56.82 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  57.17 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  56.95 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  56.95 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  56.95 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  55.48 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.3 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.67 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12670  dihydroorotase  55.66 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0696106 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.48 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.96 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.85 
 
 		 435 aa  336  5.999999999999999e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  44.42 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.37 
 
 		 429 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.64 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  46.75 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.09 
 
 		 439 aa  325  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.13 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  47.33 
 
 		 431 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.77 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  44.01 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.02 
 
 		 434 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.12 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.48 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  40.57 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.05 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  43.75 
 
 		 427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  42.49 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  47 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  43.6 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  42.86 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.49 
 
 		 425 aa  306  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  44.79 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.13 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.44 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.16 
 
 		 430 aa  302  7.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.57 
 
 		 428 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.68 
 
 		 434 aa  302  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.18 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4891  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.67 
 
 		 447 aa  299  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0481803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.75 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.17 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.42 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.18 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.93 
 
 		 429 aa  296  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.6 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.11 
 
 		 430 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  39.33 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.35 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.59 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  37.88 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  38.24 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  44.16 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.17 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.29 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  41.93 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.14 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  35.76 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.23 
 
 		 433 aa  279  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  42.3 
 
 		 428 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  41.52 
 
 		 427 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.83 
 
 		 488 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.92 
 
 		 426 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  42.97 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  39.81 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  38.16 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.31 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.69767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.52 
 
 		 437 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  39.81 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.72 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  39.81 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  37.24 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  37.5 
 
 		 430 aa  272  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>