43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0822 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  56.12 
 
 		 646 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3906  von Willebrand factor, type A  84.96 
 
 		 664 aa  1053    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0145904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3115  von Willebrand factor type A  60 
 
 		 653 aa  718    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.905029  hitchhiker  0.0000163012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8560  hypothetical protein  60.7 
 
 		 648 aa  737    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  63.18 
 
 		 655 aa  759    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  60.18 
 
 		 661 aa  765    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0822  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 665 aa  1298    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1893  von Willebrand factor, type A  62.29 
 
 		 662 aa  799    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.376882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  52.66 
 
 		 648 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1094  von Willebrand factor type A  52.46 
 
 		 674 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.723925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0550  von Willebrand factor type A  50.76 
 
 		 647 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4693  von Willebrand factor, type A  48.19 
 
 		 665 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.93356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3298  von Willebrand factor type A  48.02 
 
 		 663 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4399  von Willebrand factor, type A  48.04 
 
 		 665 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4313  von Willebrand factor, type A  48.04 
 
 		 665 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.844585  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1379  von Willebrand factor type A  47.81 
 
 		 667 aa  571  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1878  von Willebrand factor, type A  48.19 
 
 		 658 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0679777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10977  hypothetical protein  50.15 
 
 		 672 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.765365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4853  von Willebrand factor, type A  46.5 
 
 		 668 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1770  von Willebrand factor type A  49.55 
 
 		 666 aa  542  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000116678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1987  von Willebrand factor, type A  49.24 
 
 		 667 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0953  von Willebrand factor, type A  46.81 
 
 		 670 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22290  uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  46.13 
 
 		 654 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.174866  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1871  von Willebrand factor type A (vWA) domain protein-like protein  34.78 
 
 		 680 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0310  von Willebrand factor type A  34.49 
 
 		 648 aa  246  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2602  von Willebrand factor type A  35.33 
 
 		 366 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  31.52 
 
 		 382 aa  141  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3257  von Willebrand factor, type A  31.62 
 
 		 415 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0340  hypothetical protein  30.48 
 
 		 367 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000105714  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0371  von Willebrand factor type A  30.97 
 
 		 365 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3740  hypothetical protein  30.26 
 
 		 338 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5786  hypothetical protein  31.15 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4337  von Willebrand factor type A (vWA)domain-containing protein  27.58 
 
 		 372 aa  125  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4670  putative uncharacterized protein with a von Willebrand factor type A (vWA) domain  27.25 
 
 		 366 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  hitchhiker  0.00000104665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0306  von Willebrand factor, type A  28.61 
 
 		 404 aa  123  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.813873 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08796  hypothetical protein  26.5 
 
 		 372 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2430  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 		 406 aa  108  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1092  putative cytoplasmic protein  27.59 
 
 		 407 aa  104  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.18 
 
 		 673 aa  51.2  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.63 
 
 		 653 aa  48.9  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  38.02 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  26.34 
 
 		 588 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 		 329 aa  43.9  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>