More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0487 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  75.81 
 
 		 287 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  56.36 
 
 		 274 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.4 
 
 		 277 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  50.36 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  51.66 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  52.01 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  55.2 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  44.61 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  43.33 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  42.16 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  44.66 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  44.66 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  44.66 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  43.21 
 
 		 278 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  44.12 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  42.81 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2903  putative F420-dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.795057  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12191  hypothetical protein  44.5 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.69283e-42  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  36.68 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  37.32 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  35.27 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  34.47 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  38.57 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  37.07 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  37.67 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  37.32 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.88 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  42.86 
 
 		 308 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  42.86 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  42.86 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  43.2 
 
 		 325 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  32.38 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  31.85 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  34.22 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  35.12 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  32.29 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  31.85 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  34.97 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  36.75 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  36.41 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  38.42 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  34.87 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  34.87 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  34.87 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  33.33 
 
 		 306 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  36.65 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  37.82 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  32.97 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  34.03 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  33.88 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  35.21 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  41.73 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  35.88 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  29.31 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  41.01 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  31.13 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  41.01 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  32.34 
 
 		 332 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.19 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.71 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  31.38 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  37.02 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  34.52 
 
 		 311 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  29.72 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  35.84 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  34.34 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.31 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  35.86 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  31.08 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  37.95 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  36.59 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  34.25 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  34.74 
 
 		 354 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  33 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  35.08 
 
 		 363 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  41.13 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  31.07 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  35.67 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  31.9 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  30.43 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  35.42 
 
 		 371 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  34.52 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  28.64 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  33.14 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  28.64 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  35.68 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  30.98 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.11 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  34.68 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4078  luciferase family protein  37.57 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  39.39 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.43 
 
 		 353 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  28.17 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>