More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2983 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2983  ABC transporter related  100 
 
 		 653 aa  1258    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4953  ABC transporter related  64.26 
 
 		 683 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0007  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.91 
 
 		 626 aa  362  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320333  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3109  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 590 aa  360  5e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.516778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7440  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 620 aa  344  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  42.75 
 
 		 595 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1772  hypothetical protein  41.57 
 
 		 575 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3689  ABC transporter related  36.61 
 
 		 637 aa  329  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2777  ABC transporter related  37.36 
 
 		 608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.784586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4037  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 591 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.073685  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  33.22 
 
 		 583 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 616 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1142  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  38.99 
 
 		 578 aa  316  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.46 
 
 		 586 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 598 aa  313  6.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.46 
 
 		 586 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.46 
 
 		 586 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.46 
 
 		 586 aa  309  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.46 
 
 		 586 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.46 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  30.83 
 
 		 586 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.12 
 
 		 586 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3667  ABC transporter related  36.82 
 
 		 617 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4862  ABC transporter related  38.36 
 
 		 599 aa  289  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5093  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.390204 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.33 
 
 		 617 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  34.24 
 
 		 620 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.13 
 
 		 575 aa  282  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0093  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 606 aa  281  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.49 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1345  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.05 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0100192  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  31.3 
 
 		 603 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  31.54 
 
 		 600 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  35.75 
 
 		 600 aa  276  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  30.34 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 623 aa  274  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.17 
 
 		 650 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  31.88 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 586 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  30.3 
 
 		 640 aa  270  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  30.27 
 
 		 575 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.57 
 
 		 579 aa  269  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  30.27 
 
 		 575 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.6 
 
 		 556 aa  269  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  32.34 
 
 		 669 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.28 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.46 
 
 		 613 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  29.26 
 
 		 607 aa  267  5e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.12 
 
 		 607 aa  266  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.82 
 
 		 548 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  31.99 
 
 		 663 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.06 
 
 		 637 aa  265  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.2 
 
 		 625 aa  264  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  30 
 
 		 597 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1968  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 619 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  28.24 
 
 		 597 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  28.24 
 
 		 597 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  30.03 
 
 		 576 aa  263  8.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.44 
 
 		 619 aa  263  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  28.16 
 
 		 613 aa  262  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.57 
 
 		 608 aa  263  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34.69 
 
 		 598 aa  262  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  28.12 
 
 		 636 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 585 aa  261  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.55 
 
 		 582 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  32.66 
 
 		 606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  32.19 
 
 		 592 aa  260  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.8 
 
 		 637 aa  260  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.6 
 
 		 764 aa  259  9e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 811 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  30.66 
 
 		 784 aa  259  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.65 
 
 		 587 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  34.13 
 
 		 603 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  32.8 
 
 		 672 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.72 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.62 
 
 		 677 aa  258  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 629 aa  258  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  33.27 
 
 		 603 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  32.13 
 
 		 597 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.77 
 
 		 616 aa  257  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  31.52 
 
 		 598 aa  257  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.11 
 
 		 590 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  31.1 
 
 		 634 aa  257  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  31.43 
 
 		 594 aa  257  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.98 
 
 		 628 aa  256  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.44 
 
 		 597 aa  256  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  33.96 
 
 		 672 aa  256  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  28.36 
 
 		 573 aa  256  8e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  28.52 
 
 		 582 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  33.45 
 
 		 610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  31.17 
 
 		 666 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.04 
 
 		 610 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  32.53 
 
 		 608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.32 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 627 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  29.74 
 
 		 631 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  32.56 
 
 		 649 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  28.92 
 
 		 572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.83 
 
 		 768 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>