57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2903 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  92.44 
 
 		 225 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  47.06 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  47.06 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  46.57 
 
 		 273 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  45.96 
 
 		 301 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  45.37 
 
 		 304 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  46.46 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  47.94 
 
 		 222 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  46.11 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  41.59 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  42.73 
 
 		 256 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  44.22 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  39.6 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  43.07 
 
 		 449 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  38.25 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  38.81 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  34.74 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  35.6 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  35.19 
 
 		 347 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  34.09 
 
 		 327 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  39.62 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  36.22 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  37.56 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  36.62 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  35.98 
 
 		 453 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  35.05 
 
 		 532 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  37.5 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  37.56 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  35.89 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  34.26 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  33.33 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  33.17 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  35.08 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  32.98 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  33.49 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  28.76 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  31.82 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  32.54 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  33.51 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  27.72 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  27.66 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  29.35 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  30.77 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  26.9 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 		 426 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  28.21 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  31.08 
 
 		 428 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  27.69 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  27.69 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  27.09 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  26.5 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  36.49 
 
 		 82 aa  45.1  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  23.61 
 
 		 340 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  24.88 
 
 		 225 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  24.88 
 
 		 225 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>