52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2043 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2043  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  100 
 
 		 479 aa  947    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  31.54 
 
 		 822 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  32.4 
 
 		 785 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  30.88 
 
 		 790 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  31.65 
 
 		 792 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  31.65 
 
 		 792 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  30.71 
 
 		 790 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  31.62 
 
 		 790 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  28.75 
 
 		 771 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  28.88 
 
 		 778 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  31.62 
 
 		 782 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  30.17 
 
 		 782 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  31.37 
 
 		 777 aa  150  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  30.25 
 
 		 777 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  28.82 
 
 		 774 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  30.4 
 
 		 772 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  28.95 
 
 		 764 aa  139  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.1 
 
 		 775 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  29.05 
 
 		 764 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.17 
 
 		 776 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  33.92 
 
 		 712 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  28.82 
 
 		 791 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  29.44 
 
 		 791 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  28.24 
 
 		 771 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  28.94 
 
 		 761 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  27.23 
 
 		 804 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.32 
 
 		 752 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  27.97 
 
 		 789 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.61 
 
 		 784 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  28.27 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.08 
 
 		 790 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  29.21 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  29.67 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  26.77 
 
 		 761 aa  116  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  29.57 
 
 		 379 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  26.45 
 
 		 782 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  29.28 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  26.7 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  30.23 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  27.6 
 
 		 780 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3101  monooxygenase, FAD-binding  26.26 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  30.23 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  29.87 
 
 		 404 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 		 413 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  26.7 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  24.46 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.95 
 
 		 378 aa  55.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08349  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 349 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  35.11 
 
 		 401 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  32.84 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  25.49 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>