158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1992 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 281 aa  567  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  55.97 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  59.33 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  52.83 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  54.49 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  52.8 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  52.8 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  57.05 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  55.56 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  52.56 
 
 		 348 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  50.31 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  50.63 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  53.46 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  50.63 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  50.63 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  50.63 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  51.9 
 
 		 339 aa  148  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  49.07 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  51.95 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  51.95 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  51.61 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  51.25 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  49.68 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  49.68 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  48.45 
 
 		 344 aa  141  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  49.03 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  48.43 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  45.16 
 
 		 330 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  45.16 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  49.37 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.14 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  38.03 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  43.12 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  44.23 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  35.88 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  40.68 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  40.74 
 
 		 321 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  36.36 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  39.83 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31624  predicted protein  40.98 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  hitchhiker  0.00491035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  43.12 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  36.94 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  43.64 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  37.84 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  25.09 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  40.37 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  37.5 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  37.01 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  36.94 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  39.82 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  37.93 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  34.68 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  40 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  43.01 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  33.91 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  32.67 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  37.86 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  35.43 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  40.65 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  34.08 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  31.82 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  36.13 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  37.61 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  37.84 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  42.86 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  33.05 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02840  hypothetical protein  32.69 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.646987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  32.67 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.32 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  34.19 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  34.62 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  35.29 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  33.54 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  30.61 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  37.5 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10026  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11160)  37.61 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558826  normal  0.219855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  36.19 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00880  conserved hypothetical protein  35.04 
 
 		 401 aa  67  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  36.19 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  36.04 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  36.19 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  36.61 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  36.19 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  35.9 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  34.26 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  34.26 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  34.26 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34797  predicted protein  33.33 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.242371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45097  predicted protein  31.15 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  34.48 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  36.19 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05542  conserved hypothetical protein  43.59 
 
 		 414 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0412788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  35.14 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.61 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  35.9 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  34.23 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>