93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1874 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  50.93 
 
 		 558 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  50.93 
 
 		 558 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  46.53 
 
 		 502 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  44.56 
 
 		 566 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  44.56 
 
 		 566 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  44.56 
 
 		 566 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  43.9 
 
 		 559 aa  157  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  37.83 
 
 		 585 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  37.83 
 
 		 585 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  37.83 
 
 		 585 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  37.83 
 
 		 585 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  37.83 
 
 		 585 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  48.75 
 
 		 680 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  35.34 
 
 		 594 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  35.34 
 
 		 559 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  35.34 
 
 		 424 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  35.34 
 
 		 522 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  35.16 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  39.09 
 
 		 553 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  39.09 
 
 		 553 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  39.09 
 
 		 553 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  39.09 
 
 		 553 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  39.09 
 
 		 553 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  33.94 
 
 		 569 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  33.94 
 
 		 551 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  33.94 
 
 		 551 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  40.36 
 
 		 559 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  37.38 
 
 		 483 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  35.81 
 
 		 554 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  36.24 
 
 		 490 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  33.15 
 
 		 511 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7064  hypothetical protein  37.7 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.124079  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4345  transposase for IS660  25 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4629  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000090154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4779  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4530  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0775  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3836  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3694  transposase for IS660  25 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3399  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2416  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2138  transposase for IS660  25 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.677617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1513  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1062  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5116  transposase for IS660  25 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  26.32 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  26.32 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  29.13 
 
 		 406 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  33.11 
 
 		 515 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  33.11 
 
 		 515 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  33.11 
 
 		 515 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  33.11 
 
 		 515 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  33.11 
 
 		 515 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 557 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 547 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  28.26 
 
 		 472 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1178  hypothetical protein  24.06 
 
 		 512 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.216502 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1172  hypothetical protein  24.06 
 
 		 462 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0849908 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0960  hypothetical protein  24.06 
 
 		 461 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  26.76 
 
 		 576 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  33.9 
 
 		 454 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2049  hypothetical protein  55.77 
 
 		 60 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  25.25 
 
 		 472 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  25.25 
 
 		 472 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  26.67 
 
 		 486 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  29.33 
 
 		 557 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6467  transposase IS4 family protein  29.79 
 
 		 472 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1012  transposase  27.57 
 
 		 504 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662877  normal  0.9413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>