114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0721 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0721  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 534 aa  1073    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.920452  normal  0.491923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5893  glycosyl transferase group 1  81.94 
 
 		 519 aa  862    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1271  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0273586  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35087  predicted protein  27.82 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1739  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 355 aa  67  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0810  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.286793  normal  0.59117 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1814  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.506026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1213  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 384 aa  60.1  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.033035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0733  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 818 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54621  glycosyl transferase, family 1  29.57 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2037  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000383796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.45 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.19 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 359 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  26.22 
 
 		 820 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 369 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1991  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 370 aa  54.7  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  28.72 
 
 		 416 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 322 aa  53.9  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  26.22 
 
 		 820 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 		 856 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 		 820 aa  53.9  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 		 820 aa  53.9  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  26.22 
 
 		 820 aa  53.9  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 		 856 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0836  glycosyltransferase  27.55 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.260131  hitchhiker  0.000830652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  27.23 
 
 		 820 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 369 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  34.57 
 
 		 794 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20091  glycosyltransferase  28.43 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  25.64 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13661  glycosyltransferase  23.93 
 
 		 401 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.244313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  19.18 
 
 		 383 aa  52  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0836  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.367499  normal  0.134682 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1466  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 		 393 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  26.94 
 
 		 407 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1680  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1553  glycosyltransferase  30.22 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.89 
 
 		 857 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  27.69 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0516  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628757  normal  0.125688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3532  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 772 aa  49.3  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 		 890 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3127  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 		 380 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.020191  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0381  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 810 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0496  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166114  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  26.03 
 
 		 407 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 		 381 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 405 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  26.87 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0349  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.329915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 		 378 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 		 386 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2781  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 386 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3320  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 386 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3451  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 412 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 821 aa  47  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 820 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  36.05 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3728  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 397 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0346462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0032  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0810  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0314392  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1810  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0524  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 821 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 		 360 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 821 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 743 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2880  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.447923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2204  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0632  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0647  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2502  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0300016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 821 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2182  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 332 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2100  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 822 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 389 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 819 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 394 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 821 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 382 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 382 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>