57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0436 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0436  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.85 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  31.94 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  31.51 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  34.69 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.37 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.37 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  33.98 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  35.35 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  27.34 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  29.41 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  30.99 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  26.57 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  28.36 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  32.61 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  27.61 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  32.61 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  28.06 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.9 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  32.61 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  30.36 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.86 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  30.39 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  30.28 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  29.67 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  29.85 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.1 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  27.61 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  26.87 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.53 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.69 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  29.1 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1869  methylmalonyl-CoA epimerase  32.59 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  29.5 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  30.28 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  29.5 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  29.5 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  30.07 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  31.31 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1126  hypothetical protein  28.43 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1949  methylmalonyl-CoA epimerase  29.71 
 
 		 157 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.331779  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  28.43 
 
 		 134 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  26.12 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  26.43 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  27.35 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.28 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.63 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.41 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  25.74 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.48 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>