More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0365 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0365  thioesterase  100 
 
 		 361 aa  714    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.387154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  51.58 
 
 		 897 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350264 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1178  AMP-dependent synthetase and ligase  43.43 
 
 		 950 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0144635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1665  AMP-dependent synthetase and ligase  42.57 
 
 		 937 aa  255  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175798  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3137  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 866 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00387942  normal  0.129618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 1297 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  28.26 
 
 		 2867 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  30.79 
 
 		 1302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  34.39 
 
 		 3498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  28.46 
 
 		 1345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  36.02 
 
 		 1436 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  35.2 
 
 		 3824 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  35.2 
 
 		 2664 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  32.77 
 
 		 7712 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  34.95 
 
 		 1336 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  30.25 
 
 		 1021 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.28 
 
 		 2365 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  32.8 
 
 		 888 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  27.84 
 
 		 6661 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.77 
 
 		 4239 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  33.77 
 
 		 4265 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  33.77 
 
 		 4265 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.86 
 
 		 6403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.5 
 
 		 3291 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  26.01 
 
 		 2151 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  36.06 
 
 		 2093 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  40.76 
 
 		 1315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1573  thioesterase  34.13 
 
 		 561 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  31.21 
 
 		 1305 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.31 
 
 		 1363 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  32.45 
 
 		 1331 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  28.45 
 
 		 2274 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7003  acetoacetyl-CoA synthase  30.57 
 
 		 1056 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 991 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  32.43 
 
 		 5596 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0073  amino acid adenylation domain protein  26.65 
 
 		 1439 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.236187  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  35.92 
 
 		 2150 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.53 
 
 		 2385 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.21 
 
 		 2385 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  30.51 
 
 		 8211 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.6 
 
 		 2883 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.64 
 
 		 2385 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.81 
 
 		 2385 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  31.5 
 
 		 4186 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  30.37 
 
 		 1740 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.92 
 
 		 2385 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  27.92 
 
 		 2385 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.92 
 
 		 2385 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.92 
 
 		 2385 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.35 
 
 		 2385 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  32.09 
 
 		 2386 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.43 
 
 		 1336 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  32.99 
 
 		 3942 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  27.25 
 
 		 1334 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2962  amino acid adenylation domain-containing protein  29.64 
 
 		 1356 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639198  hitchhiker  0.00173398 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1213  peptide synthetase-like protein  30.49 
 
 		 1320 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1593  non-ribosomal peptide synthase  38.89 
 
 		 1346 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1675  CtaG  38.89 
 
 		 1353 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0187  syringopeptin synthetase C  38.89 
 
 		 1345 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.86 
 
 		 2352 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.02 
 
 		 13537 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.65 
 
 		 4960 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03122  putative peptide synthase protein  27.59 
 
 		 937 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  34.67 
 
 		 2845 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1439 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.65 
 
 		 4960 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  34.55 
 
 		 2875 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.96 
 
 		 4531 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  27 
 
 		 9498 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1698  amino acid adenylation domain-containing protein  33.51 
 
 		 1278 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.123455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  31.37 
 
 		 1375 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  35.29 
 
 		 6676 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  32.67 
 
 		 4991 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  35.32 
 
 		 5467 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  34.2 
 
 		 4489 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  33.17 
 
 		 2883 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.81 
 
 		 4882 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.03 
 
 		 4968 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  33.02 
 
 		 4037 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1011  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 1976 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  34.98 
 
 		 1344 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  31.69 
 
 		 7785 aa  93.2  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  28.64 
 
 		 2386 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  30 
 
 		 4520 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  31.96 
 
 		 2316 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.87 
 
 		 5926 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  33 
 
 		 3470 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  31 
 
 		 1383 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.8 
 
 		 3176 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 		 2462 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0916  acetoacetyl-CoA synthase  29.87 
 
 		 971 aa  89.4  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  34.58 
 
 		 1419 aa  89.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  29.95 
 
 		 1314 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19190  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  33.86 
 
 		 3648 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.349458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  30.62 
 
 		 1317 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  31.77 
 
 		 6006 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  31.77 
 
 		 3328 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  31.77 
 
 		 6072 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1434  amino acid adenylation domain protein  31.41 
 
 		 877 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  31.77 
 
 		 6081 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>