240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0295 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0295  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
384 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0370  hypothetical protein  39.39 
 
 
124 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.15539e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
317 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  41.07 
 
 
301 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  42.19 
 
 
297 aa  50.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  41.54 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  40.62 
 
 
404 aa  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  36.36 
 
 
262 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.39 
 
 
334 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  28.35 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  44.62 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  43.64 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  38.18 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  36.76 
 
 
519 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  30.85 
 
 
377 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1749  chaperone DnaJ domain protein  37.97 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378559  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2614  heat shock protein DnaJ domain protein  31.43 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1165  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12940  predicted protein  38.24 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.74 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  41.54 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  28.35 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  37.35 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  35.94 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0370  chaperone protein DnaJ  39.68 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.980316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  41.82 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
316 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
386 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  43.08 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  39.39 
 
 
338 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  41.82 
 
 
375 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3697  Interferon-induced transmembrane protein  39.66 
 
 
92 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.89 
 
 
323 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
374 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.62 
 
 
324 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13550  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  36.36 
 
 
385 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.685498 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  34.78 
 
 
309 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67817  predicted protein  36.92 
 
 
511 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695962  normal  0.0282737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
374 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  36.92 
 
 
333 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  52.5 
 
 
379 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  52.5 
 
 
380 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0034  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
378 aa  47  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.953723  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50996  predicted protein  38.46 
 
 
447 aa  47  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235436  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
378 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 
323 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
368 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  35.71 
 
 
303 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  32 
 
 
334 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.39 
 
 
315 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  39.06 
 
 
320 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  51.22 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3455  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  36.23 
 
 
375 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  36.23 
 
 
376 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  38.04 
 
 
248 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.32 
 
 
312 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26706  predicted protein  36.84 
 
 
343 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.676613  hitchhiker  0.00931047 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  38.46 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  38.89 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  38.46 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  36.92 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1265  chaperone DnaJ  41.43 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0905779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  34.33 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3447  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  70.97 
 
 
128 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.46 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  36.36 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  35.59 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1139  heat shock protein DnaJ domain protein  65.62 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632785  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  36.92 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  35.94 
 
 
297 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.9 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  35.82 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  42.86 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  32.31 
 
 
341 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl299  heat shock protein chaperone  33.9 
 
 
218 aa  45.1  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.65204e-51  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  51.22 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  51.22 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  51.22 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  36.23 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  51.22 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>