More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0848 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0848  NusG antitermination factor  100 
 
 		 354 aa  712    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000981169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0482  NusG antitermination factor  57.91 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000917013  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0641  NusG antitermination factor  56.9 
 
 		 356 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000301277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0467  NusG antitermination factor  57.06 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000572665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0360  NusG antitermination factor  41.24 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  49.19 
 
 		 176 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  41.54 
 
 		 175 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  44.62 
 
 		 174 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  46.92 
 
 		 185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  43.08 
 
 		 175 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  43.45 
 
 		 190 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  41.54 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  42.31 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  42.64 
 
 		 185 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  44.7 
 
 		 182 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  46.09 
 
 		 176 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  44.7 
 
 		 182 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  41.09 
 
 		 179 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  39.41 
 
 		 194 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  39.41 
 
 		 194 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  39.23 
 
 		 181 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  43.85 
 
 		 187 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  47.29 
 
 		 181 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  41.46 
 
 		 175 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  42.31 
 
 		 177 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  41.98 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  44.53 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  42.31 
 
 		 177 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  41.86 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  42.31 
 
 		 177 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  45.74 
 
 		 199 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  42.31 
 
 		 194 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  41.06 
 
 		 201 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  40.31 
 
 		 183 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  35.67 
 
 		 194 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  41.54 
 
 		 194 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  44.19 
 
 		 181 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 181 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  40.31 
 
 		 184 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 		 183 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  41.35 
 
 		 177 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  43.94 
 
 		 184 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  40.77 
 
 		 188 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  41.54 
 
 		 172 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  40.31 
 
 		 184 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  40.77 
 
 		 181 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  40 
 
 		 183 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  40.77 
 
 		 181 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  41.54 
 
 		 183 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  38.21 
 
 		 175 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  35.67 
 
 		 196 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 182 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  43.08 
 
 		 174 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  42.31 
 
 		 181 aa  104  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0593  NusG antitermination factor  41.98 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  35.67 
 
 		 196 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  36.47 
 
 		 177 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  33.73 
 
 		 186 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 182 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  42.31 
 
 		 180 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  41.54 
 
 		 183 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  40.77 
 
 		 181 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  40.77 
 
 		 181 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 182 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  41.91 
 
 		 213 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  35.5 
 
 		 197 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  40.48 
 
 		 176 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  40 
 
 		 183 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  41.54 
 
 		 183 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000164845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  44.27 
 
 		 177 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  44.27 
 
 		 177 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  34.32 
 
 		 198 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4777  transcription termination/antitermination factor NusG  34.73 
 
 		 195 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  40 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  40.77 
 
 		 183 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  35.88 
 
 		 188 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 176 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  38.24 
 
 		 185 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  37.31 
 
 		 178 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 		 181 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  40.77 
 
 		 183 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  38.24 
 
 		 185 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  39.23 
 
 		 180 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>