29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4597 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  46.15 
 
 
361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  42.67 
 
 
311 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  43.82 
 
 
303 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  47.81 
 
 
679 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  33.45 
 
 
712 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  35.15 
 
 
713 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  35.31 
 
 
788 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  37.19 
 
 
425 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  31.86 
 
 
623 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  35.18 
 
 
669 aa  136  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  36.93 
 
 
306 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  35.8 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  34.03 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  37.02 
 
 
338 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  35.44 
 
 
334 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  33.73 
 
 
455 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  34.04 
 
 
327 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  30.96 
 
 
312 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  33.48 
 
 
327 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  31.51 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  32.6 
 
 
333 aa  85.9  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  38.85 
 
 
279 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  29.41 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  30.34 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  21.38 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  27.42 
 
 
693 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  23.64 
 
 
588 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  27.42 
 
 
559 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>