27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2277 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  276  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  51.54 
 
 
140 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  42.86 
 
 
122 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  39.69 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  42.27 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  36.03 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  36 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  37.63 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  33.61 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  32.52 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  32.48 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  29.9 
 
 
231 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  33.64 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  28.7 
 
 
231 aa  48.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  28.23 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  34.55 
 
 
229 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  34.12 
 
 
270 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  33.02 
 
 
231 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  29.71 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  32.95 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  35.53 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  30.39 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  26.87 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
658 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2435  protein of unknown function DUF1573  27.68 
 
 
383 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  28.57 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>