42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0407 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  100 
 
 
170 aa  340  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  37.86 
 
 
149 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  36.48 
 
 
158 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  37.14 
 
 
149 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  36.48 
 
 
158 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  35.19 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  35.85 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  36.17 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  35.22 
 
 
158 aa  94  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  35.46 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  35.46 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  35.46 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  37.86 
 
 
156 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0246717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.51 
 
 
159 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  34.51 
 
 
159 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  37.86 
 
 
156 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  33.33 
 
 
163 aa  85.1  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  37.14 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  37.14 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  30 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  33.09 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  33.14 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  28.85 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  33.54 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  28.93 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  34.35 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  33.58 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  32.82 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  32.82 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  33.59 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  33.59 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  33.59 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  30.83 
 
 
161 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.83 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  32.82 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  30 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  30 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  30 
 
 
169 aa  51.2  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  29.32 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  28.68 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  26.15 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  24.16 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>