158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1731 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1731  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 		 85 aa  164  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.735568  normal  0.0195932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12190  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  67.5 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06260  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.34 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0413231  normal  0.0182875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  48.53 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.59 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.67 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.67 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0642  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.38 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.768801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.27 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.05 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.19 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.78 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.24 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2434  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.83 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.28 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.3 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.71 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.47 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.55 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1359  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00292788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1345  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1384  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.27 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.26 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.55 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3001  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121829  decreased coverage  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.08 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.64 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.46 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.07 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.28 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.28 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.28 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.42 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.53 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  42.11 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.03 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  46.43 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.47 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.43 
 
 		 87 aa  47.4  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.98 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1236  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1706  exonuclease VII, small subunit  39.29 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.98 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2013  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322776  hitchhiker  0.00272964 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>