More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0898 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  97.9 
 
 		 476 aa  958    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.11 
 
 		 476 aa  960    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.19 
 
 		 478 aa  833    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  85.29 
 
 		 477 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  97.9 
 
 		 476 aa  958    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  85.5 
 
 		 477 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  97.9 
 
 		 476 aa  958    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  85.5 
 
 		 477 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  98.11 
 
 		 476 aa  960    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  85.29 
 
 		 477 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  98.11 
 
 		 476 aa  960    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  98.11 
 
 		 476 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  85.5 
 
 		 477 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 		 476 aa  973    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  98.11 
 
 		 476 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.27 
 
 		 479 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2621  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  62.76 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1587  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  62.76 
 
 		 496 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.76 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.19 
 
 		 478 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.7 
 
 		 478 aa  592  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.04 
 
 		 489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.36 
 
 		 491 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003773  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.11 
 
 		 492 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02651  hypothetical protein  46.84 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.63 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.577692  normal  0.772598 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1238  hypothetical protein  47.17 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0298417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  41.95 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  35.48 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  35.64 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0236  hypothetical protein  34.41 
 
 		 538 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1726  hypothetical protein  34.1 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05895  hypothetical protein  31.19 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21160  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.2 
 
 		 561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  34.38 
 
 		 605 aa  243  7e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1356  NmrA family protein  33.06 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.055285  hitchhiker  0.0000216517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3487  NmrA family protein  34.02 
 
 		 498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 530 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 		 512 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  29.92 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04460  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.61 
 
 		 503 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.873482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  31.07 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  34.03 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1297  NmrA family protein  31.13 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000203122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.13 
 
 		 491 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.4 
 
 		 528 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6237  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00211622  normal  0.83215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  33.54 
 
 		 512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 305 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  32.14 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3532  NmrA family protein  31.79 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5626  hypothetical protein  33.54 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1242  NmrA family protein  29.05 
 
 		 498 aa  209  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.61 
 
 		 296 aa  203  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  37.5 
 
 		 311 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 		 325 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.27 
 
 		 301 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 326 aa  186  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.86 
 
 		 573 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3337  hypothetical protein  30.79 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.246336  normal  0.84548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 		 327 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 		 313 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 		 310 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000606737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 		 355 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0987842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 327 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 325 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01040  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.57 
 
 		 465 aa  170  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 325 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 325 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 		 325 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3124  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 		 335 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 298 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 335 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.837895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  29.5 
 
 		 514 aa  159  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1874  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.23 
 
 		 165 aa  137  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.943983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 382 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 382 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00493208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 		 299 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273569  normal  0.188278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1862  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5277  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 312 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 		 298 aa  90.5  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  24.32 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>