58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1874 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1874  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 165 aa  337  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.943983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  50.64 
 
 		 504 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1000  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.41 
 
 		 477 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0933  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.41 
 
 		 477 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1031  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.41 
 
 		 477 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0968  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.41 
 
 		 477 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1050  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.8 
 
 		 477 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.84 
 
 		 478 aa  147  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0973  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.23 
 
 		 476 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0898  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.23 
 
 		 476 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.23 
 
 		 476 aa  137  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2773  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 		 476 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.489378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00880  hypothetical protein  43.59 
 
 		 476 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2462  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  43.59 
 
 		 476 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 		 476 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0942  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  43.59 
 
 		 476 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.286438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00874  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  43.59 
 
 		 476 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 		 479 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02651  hypothetical protein  43.87 
 
 		 481 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.68 
 
 		 478 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2621  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  42.95 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003773  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.87 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.04 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1587  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  42.95 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1238  hypothetical protein  43.51 
 
 		 478 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0298417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 		 478 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.577692  normal  0.772598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.83 
 
 		 491 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 		 489 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.04 
 
 		 512 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05895  hypothetical protein  43.08 
 
 		 473 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  38.52 
 
 		 513 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21160  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  42.66 
 
 		 561 aa  101  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0236  hypothetical protein  45.27 
 
 		 538 aa  97.1  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  41.1 
 
 		 491 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.38 
 
 		 530 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  36.8 
 
 		 470 aa  90.5  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 482 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  38.78 
 
 		 506 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1297  NmrA family protein  38.52 
 
 		 511 aa  87.8  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000203122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1726  hypothetical protein  45.45 
 
 		 482 aa  87.8  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  41.67 
 
 		 605 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  41.96 
 
 		 513 aa  84.7  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1242  NmrA family protein  37.04 
 
 		 498 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.07 
 
 		 528 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.22 
 
 		 474 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.76 
 
 		 573 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  39.19 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6237  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 		 505 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00211622  normal  0.83215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3487  NmrA family protein  39.86 
 
 		 498 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 		 510 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5626  hypothetical protein  40.44 
 
 		 515 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3337  hypothetical protein  41.43 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.246336  normal  0.84548 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04460  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.82 
 
 		 503 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.873482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3532  NmrA family protein  33.81 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  38.93 
 
 		 498 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.803676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  36.09 
 
 		 512 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1356  NmrA family protein  33.33 
 
 		 563 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.055285  hitchhiker  0.0000216517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>