50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2486 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  337  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  337  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  98.77 
 
 		 162 aa  334  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  76.54 
 
 		 162 aa  270  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  74.69 
 
 		 162 aa  265  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  45.06 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  45.06 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  46.45 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  45.68 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  47.95 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  45.06 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  44.44 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  43.83 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  45.06 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  45.06 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  45.06 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  44.44 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  37.24 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  35.46 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  36.36 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  35.21 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  36.3 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  32.95 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  34.08 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  34.08 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  34.08 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  33.14 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  32.95 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  32.95 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  33.13 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  33.33 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  33.52 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  31.18 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  30.59 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0174095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.51 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  30.59 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  30 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  30.12 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  29.88 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  28.66 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  26.67 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  27.63 
 
 		 335 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  27.63 
 
 		 335 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  27.63 
 
 		 335 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  27.63 
 
 		 335 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  27.63 
 
 		 335 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3477  fimbrial protein  37.21 
 
 		 88 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.870738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0206  putative fimbriae  26.49 
 
 		 358 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  26.49 
 
 		 359 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  26.49 
 
 		 359 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>