More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2187 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
256 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
310 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
302 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
402 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
337 aa  92  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
362 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
316 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
308 aa  89  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
324 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
398 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0614  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.09 
 
 
529 aa  88.6  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.34 
 
 
292 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
597 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
330 aa  85.9  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
347 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.16 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  35.26 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  33.87 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
333 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.16 
 
 
326 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
379 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.18 
 
 
672 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.83 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.82 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.72 
 
 
326 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
1301 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.4 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  30.88 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  24.43 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
351 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  30.29 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
1250 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
317 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.59 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  44.68 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  27.64 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1429  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.72 
 
 
327 aa  72  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
315 aa  72  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 
351 aa  72  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  40 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  30.85 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  45.65 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  40.82 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.77 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 
1156 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>