26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0037 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  34.67 
 
 
244 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  32.82 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  34.1 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  34.1 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  31.63 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  32.98 
 
 
238 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  26.7 
 
 
235 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  29.59 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  25.93 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  62.4  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  23.53 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  29.35 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  23.75 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  25.99 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  24.2 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4434  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0252  hypothetical protein  26.59 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3659  hypothetical protein  26.59 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3966  hypothetical protein  26.59 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  22.52 
 
 
228 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  21.7 
 
 
228 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  22.52 
 
 
228 aa  41.6  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>