26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0338 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  100 
 
 
236 aa  493  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  98.73 
 
 
236 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  47.53 
 
 
244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  38.46 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  38.46 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  37.91 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  36.79 
 
 
238 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  37.44 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  34.63 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  34.1 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  23.92 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  28 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  24.02 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  29.79 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  22.69 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  21.15 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  21.15 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3659  hypothetical protein  28.12 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  26.09 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  26.09 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  26.09 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  27.74 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3966  hypothetical protein  28.12 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5210  hypothetical protein  27.84 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0252  hypothetical protein  25.81 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>