21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0217 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  100 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  47.09 
 
 
236 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  47.53 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  41.28 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  36.23 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  35.75 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  35.75 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  36.45 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  34.67 
 
 
238 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  34.83 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  39.39 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  30.36 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  25.52 
 
 
228 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  27.64 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  23.47 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  23.47 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  26.98 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  26.04 
 
 
246 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  23.2 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  25.73 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  24.02 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>