19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3965 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  99.56 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  96.49 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  38.01 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  39.47 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3966  hypothetical protein  36.04 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0252  hypothetical protein  36.04 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3659  hypothetical protein  35.03 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  34.78 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5210  hypothetical protein  34.81 
 
 		 170 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2875  hypothetical protein  35.34 
 
 		 158 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  28.72 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  23.47 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  21.15 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  21.15 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  24.36 
 
 		 273 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  22.52 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  22.52 
 
 		 238 aa  42  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>