16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0252 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0252  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3966  hypothetical protein  98.6 
 
 
215 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3659  hypothetical protein  97.67 
 
 
215 aa  431  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  39.89 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  36.51 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  37.06 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  32.54 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  36.04 
 
 
228 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  36.04 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  33.51 
 
 
228 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2875  hypothetical protein  32.79 
 
 
158 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  24.74 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5210  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  26.59 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  24.06 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  25.81 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.610599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>