26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0345 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  100 
 
 
236 aa  493  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  98.73 
 
 
236 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  47.09 
 
 
244 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  38.46 
 
 
238 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  38.46 
 
 
238 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  37.91 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  37.31 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  37.44 
 
 
238 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  34.63 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  34.1 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  27.67 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  24.4 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  27.96 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  28 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  22.69 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  21.15 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  24.02 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  21.15 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3659  hypothetical protein  25.62 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  26.09 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  26.09 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3966  hypothetical protein  25.62 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  26.09 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0252  hypothetical protein  24.06 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5210  hypothetical protein  27.84 
 
 
170 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  27.1 
 
 
220 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>