16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3966 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3966  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  440  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3659  hypothetical protein  99.07 
 
 
215 aa  436  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0252  hypothetical protein  98.6 
 
 
215 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  40.11 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  37.04 
 
 
232 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  37.06 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  36.04 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  32.54 
 
 
228 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  36.04 
 
 
228 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  33.51 
 
 
228 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2875  hypothetical protein  32.79 
 
 
158 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  24.87 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5210  hypothetical protein  32.11 
 
 
170 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  26.59 
 
 
238 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  25.62 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  28.12 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.610599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>