18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0253 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0253  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  96.93 
 
 
228 aa  454  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  96.49 
 
 
228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  39.74 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  39.32 
 
 
228 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0252  hypothetical protein  37.06 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3966  hypothetical protein  37.06 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3659  hypothetical protein  36.04 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  35.27 
 
 
225 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  31.1 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5210  hypothetical protein  35.11 
 
 
170 aa  88.6  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2875  hypothetical protein  37.07 
 
 
158 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  28.57 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  25.52 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  22.69 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  22.69 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  23.68 
 
 
273 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  21.7 
 
 
238 aa  42  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>