34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3064 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  25.73 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  29.38 
 
 		 257 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  22.91 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4434  hypothetical protein  23.71 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  27.13 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  30.61 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3659  hypothetical protein  24.87 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3966  hypothetical protein  24.87 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0252  hypothetical protein  24.74 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  24.02 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  23.18 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  24.02 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  25.91 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0335  hypothetical protein  25.65 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218104  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  26.44 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01653  hypothetical protein  30.6 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  27.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  24.68 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  28.07 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  25.96 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  25.96 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  24.49 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  28.32 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  23.59 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  25.73 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  21.82 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  23.4 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  21.82 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  21.82 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  23.73 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3965  hypothetical protein  22.52 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3658  hypothetical protein  22.52 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>