26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4690 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  40.73 
 
 
257 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  42.92 
 
 
246 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  40.74 
 
 
239 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4434  hypothetical protein  41.44 
 
 
221 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  25.73 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  22.5 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  29.35 
 
 
238 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  23.77 
 
 
222 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  24.66 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  24.66 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  24.66 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  24.66 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  24.66 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  23.2 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  24.66 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  27.89 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  30.65 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  22.6 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  24.57 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  24.57 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0299  hypothetical protein  22.81 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  25.17 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  22.37 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  24.29 
 
 
218 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
218 aa  42.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>