26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0338 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  98.2 
 
 
222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  98.2 
 
 
222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  99.1 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  98.65 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  98.65 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  97.75 
 
 
222 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  66.02 
 
 
222 aa  301  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  30.89 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  30.89 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  30.61 
 
 
236 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0299  hypothetical protein  30.37 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  31.28 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  31.28 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0335  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218104  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  31.74 
 
 
220 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  26.81 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  23.95 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  24.46 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  26.44 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  28.93 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  26.58 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  28.93 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  28.93 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  22.97 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  25 
 
 
273 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>