25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1503 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  63.96 
 
 		 222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  63.96 
 
 		 222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  63.96 
 
 		 222 aa  285  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  63.96 
 
 		 222 aa  285  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  63.51 
 
 		 222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  66.02 
 
 		 222 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  66.02 
 
 		 222 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  30.73 
 
 		 236 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  30.73 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  30.73 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0335  hypothetical protein  33.53 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218104  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0299  hypothetical protein  30.24 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  26.58 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  23.36 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  26.11 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  23.95 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  26.42 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  26.42 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  26.42 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  24.53 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4434  hypothetical protein  23.5 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>