23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3389 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  83.61 
 
 		 238 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  83.61 
 
 		 238 aa  418  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  83.19 
 
 		 238 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  37.37 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  36.87 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  36.2 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  32.52 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  31.32 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  33.16 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  24.53 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  23.5 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  25.47 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  25.47 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  25.47 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  25.47 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  25.47 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  25.32 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  22.86 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  24.07 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  24.55 
 
 		 257 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>