28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3972 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4568  hypothetical protein  49.12 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  41.42 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  40.73 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4434  hypothetical protein  41.88 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  29.38 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  25.58 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  26.32 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  26.32 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  26.97 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  23.75 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  26.15 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  26.15 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  26.97 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  29.5 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  29.5 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  26.09 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  25.45 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  25.45 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  28.06 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0299  hypothetical protein  25.45 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0335  hypothetical protein  25.79 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218104  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2876  hypothetical protein  23.2 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  23.97 
 
 		 228 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  22.06 
 
 		 260 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>